保加利亞自然歷史博物館建立於1889年，位於其首都索菲亞，臨近當地的俄羅斯教堂。該博物館隸屬於保加利亞科學院，是巴爾乾半島第一個、同時也是最大的一個自然歷史博物館。
該自然歷史博物館最初作為保加利亞斐迪南一世自然歷史博物館而建立，在1947年成為保加利亞科學院動物學研究所的一部分之前，先後有多位國內和國外的專家擔任博物館的館長。目前，博物館內收藏有400多個酷似活物的哺乳動物，1200多種鳥類，成千上萬種昆蟲和其他無脊椎動物，以及全球約四分之一的礦產樣品。館內的展覽非常豐富，主要分為九大展區：近期哺乳動物化石、近期鳥類化石、魚類、兩棲類和爬行動物、昆蟲、非昆蟲無脊椎動物、無脊椎動物化石、礦物和岩石、植物類。
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