馬耳他國家自然歷史博物館位於有著中世紀城牆的姆迪納城，處在一棟建立於18世紀的古建築內。該博物館從20世紀60年代中期已經形成，直到1973年纔正式對公眾開放，現今由馬耳他遺產管理機構負責其管理運營。
馬耳他國家自然歷史博物館是一個布滿各種生物標本的國立知識庫，生命和地球科學是博物館的展覽核心，當然，集中於馬耳他群島的自然歷史。走進此博物館，您可以縱覽馬耳他豐富多彩的生態系統，包括陸地上和水裡的。博物館重點展示馬耳他群島當地的植物和鳥類，比如馬耳他矢車菊和藍磯鶇等；其代表性展覽主題包括人類進化、昆蟲、鳥類、棲息地和海洋生態系統。此外，博物館還展出與地質和古生物相關的礦物、化石、昆蟲、爬行動物、鳥類、哺乳動物和魚類等，同時也有許多國外的動植物標本。
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